大蒜最忌讳的肥料是未熟的农家肥。
未腐烂的农家肥料含有多种有害于大蒜的病菌、幼虫和杂草种子，会引起大蒜病虫害。
大蒜可以按生长发育和需肥、吸肥特点进行施肥，大蒜施肥应以有机肥为主，化肥为辅；以基肥为主，追肥为辅的施肥原则。最大限度地满足大蒜在生长发育过程中对营养元素的需要。大蒜施肥一般分基肥和追肥两种。
大蒜的基肥以有机肥为主。常见的有机肥有圈肥、鸡粪、鸭粪、厩肥、堆肥、饼肥等。基肥的使用量是否充足，直接关系到大蒜蒜头的商品性和植株的越冬性能，因此在生产上应施足基肥。
从大蒜的幼苗期到鳞茎收获前的各个生育时期，根据其生长发育和需肥、吸肥特点，分期进行施肥，即为追肥。大蒜的追肥一般以氮肥为主，需要时氮、磷、钾肥及各种元素应配合施用，这有利于大蒜的正常生长发育，有利于促进养分的吸收利用和增进品质。
扩展：大蒜返青以后，就需要多次追肥，追肥可以选择硫酸钾、磷酸和硫酸钾型复合肥。早春的追肥以氨肥为主抽薹期追施氮肥，适当搭配磷钾肥或者冲施水溶肥。后期控氮，防止蒜头开裂和散瓣蒜，可以喷施磷酸二氢钾促进蒜头膨大。